การสร้าง pangenome

pangenome เกิดขึ้นได้จากการพัฒนาเทคนิคการคำนวณขั้นสูงเพื่อจัดลำดับจีโนมหลายลำดับให้เป็นหนึ่งเดียว การอ้างอิงที่ใช้งานได้ในโครงสร้างที่เรียกว่ากราฟ pangenome Paten และนักวิจัยในห้องปฏิบัติการ Computational Genomics ของ UCSC ช่วยนำไปสู่ความพยายามของ HPRC ในการพัฒนาวิธีการอัลกอริทึมที่จำเป็นในการสร้างโครงสร้างกราฟ pangenome นี้ เนื่องจากวิธีการที่ใช้ในโครงการนี้ จีโนมทั้งหมดภายในการอ้างอิง pangenome จึงมีคุณภาพและความแม่นยำสูงมาก ครอบคลุมมากกว่า 99 เปอร์เซ็นต์ของจีโนมมนุษย์แต่ละรายการโดยมีความแม่นยำมากกว่า 99 เปอร์เซ็นต์ Mobin Asri, Ph.D. สาขา bioinformatics กล่าวว่า "ในการอ้างอิงเชิงเส้น เรามีเพียงหนึ่งลำดับ หนึ่งตัวแทนของยีนแต่ละตัว สุขภาพและร่างกาย ผู้สมัครที่ UCSC และผู้เขียนร่วมคนแรกในเอกสารหลัก "แต่เรารู้ว่ายีนของเรามีรูปแบบต่างๆ กันในประชากรมนุษย์ การใช้กราฟ pangenome เราต้องการให้มีรูปแบบต่างๆ เหล่านั้นทั้งหมดในโครงสร้างเดียว และกราฟก็เป็นวิธีที่เป็นธรรมชาติในการทำเช่นนี้"